心源性栓塞指的是由于心脏内的血栓栓子脱落以后，引起相应器官的血管堵塞。像风湿性心脏病在左心房内形成血栓，或者感染性的心内膜炎赘生物脱落以后，都可以造成相应器官的栓塞，这种栓塞就叫心源性栓塞。
大部分的心源性栓塞，栓子来源于左心，所以栓子脱落以后，主要是引起动脉血管的栓塞。包括心脏冠状动脉栓塞会引起心肌梗塞，脑血管栓塞会引起脑血栓，下肢血管栓塞会导致下肢的缺血性坏死。
总之，有心脏的器质性疾病，特别是有房颤患者，要对栓塞危险性进行评估。如果危险程度比较高，要尽早使用抗凝药物，目的就是为了预防栓塞并发症的发生。