肛乳头瘤如果引起了肛窦的发炎，或者是直肠黏膜的发炎，可以使用中药进行保留灌肠，或者是使用药膏和药栓直肠内给药。如果出现了细菌的感染，可以口服抗生素药物进行对症的治疗。
肛乳头瘤往往都是由于肛乳头肥大进一步的增生，最后发展成了瘤样的结构，可以随粪便排出到肛门外，可以刺激肛门周围的皮肤出现潮湿、瘙痒和疼痛，还会产生肛门的坠胀不适。
肛乳头瘤如果想要进行彻底的治疗，主要的治疗方法还是需要通过手术进行治疗。肛乳头瘤在手术之后，也一定要按时进行换药，保持手术创面引流的通畅，保持肉芽组织的新鲜，促进术后伤口的愈合。