功能性消化不良不是一个症状而是一组症状。功能性消化不良影响了全球1/4以上的人。部分患者消化不良的症状可以自行改善或缓解，但是一半以上的患者，会慢性间断发作，大部分患者最终会去寻求药物治疗。
功能性消化不良在不同的患者身上会有不同的表现，通常是指上腹部出现疼痛或不适，可同时伴有胀气、早饱和胀满感、恶心、纳差、胃灼热、反胃和嗳气。患者常常主诉数个症状。
临床上常采用罗马Ⅱ诊断标准诊断功能性消化不良。功能性消化不良的发病率在女性中略微升高，而且随着年龄的增长而下降，每年有1~6%的以前无消化不良症状的人会出现先消化不良症状。病史较长受教育程度低或者有心理社会应激的患者，症状缓解的概率比较低。