小肚子疼腰疼应该先确定是哪一种疾病，然后再具体治疗。
小肚子疼腰疼可能是慢性盆腔炎，确诊后患者主要借助活血化瘀功效的药物治疗，可以采用灌肠给药或者口服药物，都能促进盆腔炎症被吸收。也可以使用中药热敷下腹部，能够活血化瘀。
小肚子疼腰疼也可能是肾结石引发，建议患者接受双肾输尿管彩超检查，借此检查确诊是否有肾结石。对于较小的肾结石，一般不需要特殊处理，多喝水就能排泄掉。体积比较大的肾结石，形成梗阻不严重，也没有对肾脏产生伤害，可以采用微创手术进行治疗。