小便有黑色颗粒，一般是由于上尿道或者膀胱出血，形成淤血后，淤血随着尿液从尿道排出和尿液中的酸性物质发生化学反应引起的，从而导致小便里出现黑色颗粒。
尿液里出现了黑色颗粒，还和患有尿路系统结石有关，因为结石从尿道排出时，如果结石数量较大，体积较小，就也会存在该现象。
其次服用部分抗结核药物和抗凝药物后，会使血小板异常增多，此时也容易形成尿道淤血，导致该症状出现，建议做尿常规检查和其他相关检查，明确具体原因。