根据肝癌的不同阶段酌情进行个体化综合治疗，是提高疗效的关键。治疗方法包括手术、肝动脉结扎、肝动脉化疗栓塞、射频、冷冻、激光、微波以及化疗和放射治疗等方法。
1.手术治疗，手术是治疗肝癌的首选，也是最有效的方法。手术方法有：根治性肝切除，姑息性肝切除等。 对不能切除的肝癌可根据具体情况，采用术中肝动脉结扎、肝动脉化疗栓塞、射频、冷冻、激光、微波等治疗有一定的疗效。原发性肝癌也是行肝移植手术的指征之一。
2.化学药物治疗，经剖腹探查发现癌肿不能切除，或作为肿瘤姑息切除的后续治疗者，可采用肝动脉作区域化疗栓塞；对估计手术不能切除者，也可行放射介入治疗，经股动脉作选择性插管到肝动脉，注入栓塞剂（常用的如碘化油、明胶海绵颗粒）和抗癌药行化疗栓塞，部分患者可因此获得手术切除的机会。
3.放射治疗，对一般情况较好，肝功能尚好，不伴有肝硬化，无黄疸、腹水、无脾功能亢进和食管静脉曲张，癌肿较局限，尚无远处转移而又不适于手术切除或手术后复发者，可采用放射为主的综合治疗。