先天性肠道闭锁，目前要分为高位性还有低位性。
如果是高位性的先天性肠道闭塞，处理起来是比较困难的。因为高位性肠道闭锁大部分肠道还没有完全发育好，需要先进行肠道造漏，等人工肛门形成之后再进行手术，将肠道连接，这样就形成了真正的肛门。
如果是低位性肠道闭锁，一般就比较好处理。有的只是将表皮直接切开，这样就可以形成肛门。
其实，做完手术之后，主要的后遗症仍然会出现肠道的消化不良，如出现腹痛、腹泻，易于并发痔疮，或者是肠道出血以及狭窄。