夜间咳嗽的原因，除了与环境温度变化有关之外，还可能与过敏性疾病、消化道疾病有关。
在环境温度过低的情况下，机体容易受到各种病毒或者细菌的影响，在呼吸道受到感染后，最常出现的症状就是咳嗽。所以，这也是导致夜间出现咳嗽的主要原因之一。
在夜间由于接触到过敏原，如粉尘等，或者受到冷空气的影响，也会诱发变异性咳嗽，在临床主要表现为凌晨或者半夜出现持续性干咳。
消化道疾病中的胃食管反流也会引起刺激性咳嗽，而且也常常在夜间发病。