萎缩性甲状腺炎不是甲减引起的，但是甲减的病因中有部分是因为萎缩性甲状腺炎引起的。萎缩性甲状腺炎也是慢性自身免疫性甲状腺炎中的一种。
大部分萎缩性甲状腺炎的患者都是会出现甲状腺功能减退症，这需要终身给予甲状腺素片的替代治疗。如果是不及时给予替代治疗，那有可能会引起患者怕冷、乏力、纳差、浮肿，严重者会导致粘液性水肿性昏迷。
当患者抽血体检时发现甲减，那要完善甲状腺彩超及甲状腺抗体检查，来判断是萎缩性甲状腺炎还是其他的一般的甲状腺炎。因为在临床上一旦确诊为萎缩性甲状腺炎引起的甲减，那是需要终身给予药物治疗的。