乳腺囊肿有可能会引发乳腺癌，但是临床上对于它确切的发病机制，目前尚不明确。
乳腺囊肿属于乳腺的一种良性的疾病，这种良性疾病都具有一定的癌变率。除了囊肿之外，乳腺的腺瘤也可以导致乳腺癌的高发，但是确切的病因目前还是不明确的。乳腺囊肿可能是考虑病变的存在，对于乳腺的正常细胞长期的进行刺激，从而导致细胞发生恶变，形成乳腺癌，也有可能是患者体内的雌激素水平异常，从而导致乳腺囊肿最终发展成为乳腺癌。因此，对于患有乳腺囊肿的患者，要定期的进行随访，及时的发现病情的变化，以防止癌变的发生。
一旦乳腺囊肿发生癌变，形成了乳腺癌，则需要根据患者的临床分期以及体质情况等多方面因素，来决定治疗策略。