导致肛周脓肿形成的原因主要有以下：
第一，肠道菌群失调以及免疫力低下，肛周脓肿感染细菌中检出率最高的为大肠杆菌，而熬夜、旅途劳顿、大量饮酒、进食辛辣刺激性食物等等导致免疫力低下的因素，也是诱发肛周脓肿的原因。
第二，肛窦炎，由于感染的肛窦是肛周脓肿感染的入口，所以肛窦炎是引发肛周脓肿的主要原因。
第三，肛腺感染，肛腺的感染会经肛门括约肌间隙以及淋巴管，波及肛管直肠周围各个间隙，而导致肛周脓肿。
第四，其他因素，例如直肠损伤、肛裂、医源性的损伤、血行感染等，也会引发肛周脓肿。