首先，组成成分不同。医用生理盐水为0.9%的氯化钠溶液，碘伏为1%的络合碘溶液。
其次，外观不同。生理盐水是无色、透明的，而且它的渗透压与人的血液渗透压相近，而碘伏为棕黄色，不透明。
最后，用途不同。在临床工作中，盐水可以作为补充液体，给患者静脉输注。同时，也可以作为溶剂配比抗生素给患者输注，在外科清创时也可以作为冲洗剂，冲洗伤口的污染物，使用用途比较广泛。碘伏作为消毒剂和杀菌剂，常用于手术部位的消毒以及伤口和黏膜处的换药、消毒。其能够有效地杀灭定植于人体皮肤处的细菌和伤口内的细菌。对碘制剂过敏的患者不可以用碘伏。