当出现眼角膜的外伤时，不能用碘伏擦拭消毒，碘伏会刺激角膜，引起角膜的反应，甚至会造成视力的损害，所以是不能用碘伏的，而应该使用大量的无菌生理盐水冲洗，再配合使用抗生素眼药水来消毒。
而其它部位的创伤，都可以使用碘伏来消毒，如果只是表皮的擦伤，使用碘伏消毒后，自然晾干就可以了；如果创面比较深，需用双氧水和生理盐水反复的冲洗，再用碘伏消毒。
如果是会阴部、黏膜等部位的消毒，则一般选择碘伏消毒，而不选择酒精消毒，因为碘伏的刺激性更小，病人耐受性好。