肠瘘会导致休克，肠瘘可导致感染性休克以及低血容量性休克。
肠瘘患者如果肠内容物流入腹腔，会导致腹腔出现严重的感染，感染物质以及细菌会通过大网膜吸收入血，而引发脓毒血症，继而导致感染性休克。一些上消化道的肠瘘会导致大量的消化液流失，腹腔内的感染也会引起液体的流失，从而会引发低血容量性休克，而且大量消化液的流失，很快会导致水电解质平衡紊乱，严重的会导致患者的死亡。
长期的消化液流失、感染以及营养物质的丢失，会造成患者出现严重的营养不良。