自然流产如果没流干净是否会来姨妈，需依据宫内残留的大小以及患者恢复的情况而定。如果宫内残留物较多并影响了子宫的正常恢复，同时检查发现血HCG仍异常升高，可能患者会出现阴道不规则流血，月经的复潮时间会继续推后。
但如果宫内只是微量残留，患者没有出现阴道异常流血、腹痛等情况，恢复良好，一般月经会正常来潮并且残留物伴随经血一块排出，无需特殊处理。
因此，对于自然流产后的女性，建议定期复查超声检查等相关的检查后再做进一步的处理。