电子直肠镜检查有点疼痛。但是大多数人能够忍耐，不会特别剧烈疼痛。
疼痛感因人而异，每个人对疼痛的敏感程度存在差异，或者在检查过程中心情过度紧张、焦虑、害怕，也会导致检查过程不顺利，疼痛的程度可能会稍微明显。检查时一般采取侧卧位，放松心情，放松肛门括约肌，能够使肠镜顺利进入直肠内，可减轻疼痛。
做完直肠镜后，要注意饮食清淡，最好能吃容易消化的流质和半流质饮食，暂时吃少渣的食物，避免吃辛辣、刺激的食物。