来月经的第5天小腹痛，通常有以下几种原因：
1.在经期体内前列腺素的大量分泌，导致子宫出现平滑肌痉挛的现象，这时候小腹就会伴有疼痛的症状。
2.经期食用了过于寒凉的食物或者不注意腹部的保暖，使经血淤积不畅而引起的小腹疼痛。
3.有可能是子宫内膜异位症或子宫腺肌症导致的小腹疼，可以行B超检查帮助观察子宫以及附件有无出现内膜异位的表现，因为异位的子宫内膜经期脱落、出血也会导致小腹疼痛。
4.小腹痛也可能是妇科炎症所致，需要在经期结束3天以后行妇科检查，并对分泌物进行检测，明确感染的病菌类型以对症治疗。