甲状腺功能异常分为甲亢和甲减。甲亢的病因，有甲状腺性的病因，还有垂体的原因，以及异位TSH分泌过多也可以引起。最常见的就是甲状腺性的病因，有弥漫性毒性甲状腺肿、桥本甲亢、碘甲亢，还有亚急性甲状腺炎出现的一过性的甲亢。垂体的TSH瘤可以引起继发性的甲亢，另外，体内其他部位的肿瘤可以分泌类TSH的物质，也可以引起甲亢。甲减的原因有甲状腺性的原因还有垂体的原因。甲状腺性的原因，最常见的就是桥本甲减，还有甲亢碘131治疗后，甲状腺手术以后。垂体的原因包括由腺垂体功能减退症，或者是垂体瘤，都可以引起甲减。