化脓性中耳炎发病后，应当首先应用青霉素类的抗生素药物、头孢菌素类的抗生素药物，或大环内酯类的抗生素药物来控制耳道内的炎症感染。炎症感染得到有效控制后，中耳炎的情况就会好转。
其次，化脓性中耳炎通常会导致耳道内有大量的脓液渗出，患者还可以使用生理盐水对耳道进行灌洗，或者是局部使用氧氟沙星滴耳液等药物滴入耳道内，改善耳道内的化脓以及充血、水肿的表现。
如果患者出现了鼓膜的穿孔，且穿孔的面积比较大，还可以选择进行鼓膜修复手术的治疗，治疗后定期复查。