细菌病和真菌病的区别在于发病的原因、皮肤表面的形态以及治疗手段上。
从发病原因角度考虑，真菌病就是真菌感染导致的，而细菌病是细菌感染导致的，虽然都属于微生物，但是是两种完全不同的微生物。
从临床症状角度考虑，真菌病容易引发患病部位出现瘙痒，局部皮肤表面容易出现红斑、丘疹、糜烂、渗出、角化、皲裂等改变，一般不出现疼痛。而细菌疹引发的这些细菌性疾病会在局部皮肤表面出现一些感染性质的变化，会出现红肿、疼痛等变化，伴随着明显的按压性疼痛。
治疗方面真菌病建议选择抗真菌治疗，而细菌病建议以抗生素来杀灭细菌，治疗的方向也是不一样的。