房颤患者要保护肾脏功能，首先要针对房颤进行治疗，特别是要控制房颤患者的心室率，避免心室率过快。一般选择洋地黄中的地高辛口服，或者使用倍他乐克口服，将房颤患者的心室率控制在合适的范围。要求：
在休息状态下，心室率80次左右，在活动状态下最好不超过100次，心室率控制了，房颤患者心脏的射血改善了，对肾脏功能就可以起到保护作用。
再就是，使用抗凝药物华法林，预防心脏内的血栓形成，避免栓子脱落导致的肾动脉栓塞。
通过上述措施，积极治疗，就可以起到保护肾脏功能的作用。