软骨损伤的治疗方法取决于软骨损伤的严重程度。
如果只是轻微的软骨损伤，没有引起关节活动受限等严重的症状，主要是进行保守治疗，限制关节部位的活动，降低体重，对局部进行针灸、按摩、热敷等物理疗法进行辅助治疗，也要口服营养软骨的药物，促进软骨的恢复，比如硫酸氨基葡萄糖。在疼痛的症状比较严重时，可使用非甾体抗炎药缓解，也可对局部进行封闭治疗。
如果保守治疗效果不佳，关节软骨全层都出现了缺损，应当进行对软骨进行修复，将游离体取出，在术后还需加强护理，促进软骨的恢复。