1.前葡萄膜炎主要和以下疾病进行鉴别：孔源性视网膜脱离，视网膜裂孔脱离，玻璃体或前房内有色素细胞；眼内肿瘤，如儿童的视网膜母细胞瘤或白血病；成人的恶性黑色素瘤等进行鉴别。青少年黄色肉芽肿，小于15岁，常有自发性前房积血，虹膜有黄灰色、边界不清的结节，轻度隆起的橘红色皮肤病灶。
2.前葡萄膜炎还需要和眼内异物，巩膜葡萄膜炎，眼内炎等进行鉴别。
3.后葡萄膜炎主要和以下疾病进行鉴别：
（1）网状组织细胞肉瘤，50岁以上患者持久有玻璃体细胞，全身应用皮质激素无效。
（2）恶性黑色素瘤，视网膜脱离和玻璃体炎症使下面的肿瘤模糊不清，B超常常可以诊断。
（3）视网膜色素变性，玻璃体细胞和黄斑水肿可以伴随骨细胞样色素沉着，视网膜血管变细。
（4）孔源性视网膜脱离，经常伴随前房玻璃体少量色素性浑浊或前葡萄膜炎。
（5）眼内异物，眼球贯通伤后持续性炎症，或有虹膜异色，通过间接检眼镜、b超、超声生物显微镜或者眼球ct诊断。
（6）后巩膜炎，伴和不伴有前巩膜炎，玻璃体炎伴有视网膜脉络膜皱褶，荧光素眼底血管造影、b超有助于诊断。
（7）淀粉样变性病，比较少见，玻璃体无炎症表现，血清蛋白电泳和诊断性玻璃体切除术可以确诊。
（8）星状玻璃体浑浊，小的白色的反光颗粒粘附于胶原纤维，在玻璃体中漂浮，常常无症状，无临床意义。