直肠扁平息肉是否严重，需要结合病理结果。
如果病理检查为非肿瘤性息肉并不严重，一般并不会导致恶变，大多是由于肠道炎症所导致的，以治疗原发性疾病为主。
如果病理检查为肿瘤性息肉，局部还没有癌变的，仍然属于良性息肉，应及时行切除术，防止其接下来出现恶变，可以选择在内镜下切除。距离肛门近的，也可以经肛直视下切除。
如果局部有癌变的，就可以称之为直肠癌，相对就比较严重，应及时行根治性切除手术，并根据术后病理结果决定下一步治疗方法。