盲袢综合征中有肓袢是本病的主要原因，可引起肓袢内细菌增长，小肠淤积及肠异常通道。
肓袢综合征因为小肠狭窄、硬皮病、肠神经功能失调等因素导致，但主要是对于胃切除、胃肠吻合术后有盲袢形成者，可以选择药物治疗。
第一，抗生素治疗因为感染的细菌类型比较多，应依据病原菌培养的结果来制定治疗方法，以免形成耐药菌株。
第二，选择营养支持治疗。肠黏膜受损而引起吸收障碍，恢复过程比较慢，可选择由肠外途径给予补充，患者预后大多良好。