克山病采用综合治疗，需要控制心衰、纠正心律失常，有时甚至需要抢救心源性休克。
对于急型克山病，需要静脉注射大剂量维生素C一周左右，服用改善心肌的药物如辅酶A或辅酶Q10等，应用血管活性药物、使用强心药等。对于慢型克山病，需要控制心衰和心律失常，防止感染、过劳、受寒等，降低诱因、减轻心脏负担，需要补充硒元素，一般选择口服硒化钠以此减轻对心肌的损害。
对于亚急性克山病，治疗原则同慢型，此外可以使用转化酶抑制剂、利尿药物改善心脏供血。