肺不张和肺栓塞的区别有以下几点：
首先，两者属于不同种类的疾病，肺不张是因为各种原因导致局部支气管阻塞而引起的改变，肺栓塞是因肺动脉及其分支有血栓阻塞而引起。但要注意，部分肺栓塞可以导致肺梗死，此时也可以见到肺部有类似于肺不张样的影像学改变，要注意鉴别，但两者最终还是要靠肺动脉CT造影检查，肺栓塞通过此检查可发现肺动脉及其分支有血栓的形成。
另外，两者临床症状也有明显的区别，肺栓塞病情多较危重，多是以咯血、胸痛、呼吸困难为其主要表现，而肺不张的症状和病情较肺栓塞相对较轻。
此外，两者在治疗上的区别，肺栓塞患者需视情况予以抗凝或溶栓的处理，而肺不张多需要针对病因的治疗，患者多需要进行支气管镜相关检查和治疗。