来例假时后脑勺疼的原因如下：
1.例假时后脑勺受凉。当外界环境温度较低的时候，后脑勺受凉会有疼痛症状。这时如果能够及时回到温暖的环境当中，症状可逐渐好转。
2.如果来例假的时候长时间低头工作，会引发颈椎病发作。本病的特点为后脑勺疼，伴有颈部及患侧上肢疼痛的特点。
3.考虑和内分泌因素有关。在例假的时候人体的雌激素水平下降，引发血管神经性头痛，有时会出现后脑勺疼痛的症状，当例假过后头痛症状会自然消失。