卵巢囊肿做切除手术之后是否还能生育，并不是每个人都会一样。比如大多数的卵巢囊肿患者做的手术是卵巢囊肿剥除手术，也有的是根本不会影响到卵巢的功能的，不影响排卵和将来输卵管拾卵功能。
也有部分卵巢囊肿患者是巧克力囊肿，虽然是属于良性肿瘤，但是确实在即使是做卵巢囊肿剥除手术保留了卵巢，之后也是比较容易影响到卵巢功能，有的就会导致排卵障碍，而导致不孕症的发生。
也有可能还因为其他位置的子宫内膜异位症，比如输卵管而导致病症，所以存在比较大的个体差异。