免疫力与扁桃体发炎有一定的关系。
扁桃体本身属于人体的免疫器官，且扁桃体由于其生理解剖结构的特点，决定了扁桃体表面存在很多的扁桃体隐窝，容易造成细菌或病毒等的积存。但是正常情况，也就是人体的免疫力功能比较好的情况，扁桃体隐窝内存在的病毒或细菌并不会大量繁殖，因此也不会造成扁桃体发炎的情况发生。
但是当人体过度疲劳、频繁熬夜、精神过度紧张、或者是受到外界过冷或过热的空气刺激等诱因时，扁桃体内的细菌或病毒就会大量繁殖，导致发炎的情况出现。