做完肠镜后肚子疼，大多属于正常。
做肠镜之前要做肠道清理，再加上肠镜本身属于侵入性的检查，对肠道黏膜会造成一定的刺激，在做检查过程中会注射生理盐水或者气体，所以在做检查后会出现腹痛、腹胀，尤其是敏感的患者会感觉疼痛明显，这是正常的表现，一般通过排气后一两个小时就可以恢复。
如果持续性肚子疼时间比较长，大便出血，考虑是其他因素导致，可能是消化道穿孔等，这种情况需要做相关的检查，了解其原因后，给予对因处理。