双肾结石是否严重，需要根据结石的位置、大小，是否合并感染、肾积水、输尿管梗阻等情况来判断。
如果只是单纯的微小结石，并没有引起一些并发症，一般不严重，通过口服药物或碎石手术等治疗，就可以将结石排出。如果双肾结石比较大，而且诱发了感染，可能会导致出现急性肾盂肾炎，这种情况就比较严重，需要进行及时抗感染治疗，以免引起菌血症，需要对结石及时地进行处理。
如果结石引起肾积水，长期的肾积水就会压迫肾皮质，造成肾皮质萎缩，严重的可能会引起肾功能丧失。双肾出现结石比单肾结石要严重，对于双肾出现结石，无论结石大小，都需要进行及时地治疗，以免造成严重的后果。