新生儿泪囊炎和角膜炎感染的部位不同，表现也不完全一样。两种疾病都可以有流泪的情况，但是角膜炎畏光流泪，患儿因为疼痛哭闹异常。而泪囊炎是由于感染分泌物增多为主要表现。
由于先天性的发育障碍，鼻泪管的开口处膜状物没有及时的退化，泪液及泪囊分泌物没有办法及时的排出，引起鼻泪管继发细菌感染。炎症可以在一侧发生，病情比较缓慢。
患儿可以有眼泪从眼角流出，轻挤按压泪囊部可触及肿块或者分泌物增多，结膜可能会有轻度的充血。由于角膜受到外伤过敏或者是感染引起的炎症，以疼痛、畏光、流泪为主要表现。