预防肛门剧痛就要从预防肛门的疾病做起，因为任何的肛门疾病都有可能会导致肛门疼痛。
肛门的神经分布非常丰富，几乎所有的肛门疾病都可以引起肛门疼痛，发病率最高的、引起肛门疼痛的疾病是痔疮，当痔组织伴有感染、水肿时，可以引起肛门剧烈的疼痛，因此，需要避免一切可以引起腹压增高的情况。肛裂会导致肛门括约肌以及神经末梢外露，从而容易引起受到摩擦，引起肛门剧痛。
因此，要积极的预防习惯性便秘、肛周脓肿、肛瘘以及肛门皮肤感染等疾病，也可引起肛门疼痛，因此，需要注意肛门卫生，提高免疫力。