孕期患有甲亢多是需要服用丙硫氧嘧啶来治疗，尤其是孕早期的患者，因为早期是胎儿的神经，以及各器官形成的主要阶段，丙硫氧嘧啶的副作用相对比较小，对胎儿产生的不利影响也会少很多，所以是孕期治疗甲亢的首选药物。
如果到了孕期的中晚期仍然存在甲状腺功能亢进的情况，可以选择甲巯咪唑来治疗，因为它的抗甲亢的效果要更强，一些对肝脏产生的损伤相对也比较小。
需要注意，一定要严格控制好药物的用量，尽量用最小的剂量来使甲功维持到正常范围，以免过量应用引起孕妇的甲减，以及胎儿的甲状腺肿大等不良后果。