肠系膜淋巴结结核的治疗方法有：
药物治疗。在治疗时一般多会选择抗结核类药物进行治疗。但是，抗结核类药物的种类比较多，具体的药物名称及药物剂量需要按照医嘱。而且，在用药的过程当中还需要多注意药物的不良反应。如果服用药物期间出现身体不适症状，也需要及时就诊。
手术治疗。对于患有肠系膜淋巴结结核的患者，如果出现反复发作或者是有肠梗阻、肠瘘等并发症出现时，可以及早地进行手术治疗。
大部分的肠系膜淋巴结结核患者经过正规的抗结核治疗后，预后良好。