胸内肾一般位于体内后纵隔，其突出到胸腔的部分横膈膜变薄，仅有一层薄膜覆盖在肾脏表面，因此肾脏并不是游离在胸腔之内，大多数的胸内肾患者没有任何临床表现，其呼吸系统症状非常少见，泌尿系统症状更是少见，大多数患者在行常规的胸片或者是胸部ct检查，或者因中隔肿瘤开胸手术时，偶然发现胸内肾。
患者的输尿管一般是增长的，但膀胱开口的位置一般情况下没有异常，一侧胸内肾患者的对侧肾脏大多正常。