黄体功能不全的诊断金标准是做子宫内膜活检，是要看子宫内膜是否明确是有分泌期改变，但是这样的检查和治疗是不容易被人群接受的。
一般就是会选择其他的辅助诊断的方式，是要求要监测排卵的情况，在排卵后一周左右的时间抽血看孕酮的水平，因为在这个时间应该是属于孕酮的高峰期。如果孕酮值太低，就是要考虑黄体功能不全，是有可能会因此而影响到胚胎着床的几率，影响到之后胚胎正常的发育，这样有不孕症的人群，就要考虑从排卵之后就开始加用孕激素做黄体支持，提高怀孕成功的几率。