结缔组织痣和结节性硬化病的区别在于发病的原因和临床症状。
结缔组织痣一般是与遗传有关。一般是常染色体显性遗传而导致局部结缔组织发育缺陷而引发的一些疾病。而结节性硬化病则与自身的随机细胞分裂错误有一定的关系，本身属于一种基因突变。当然，有遗传性基因的人群也可能会出现这种结节性硬化症。
而从临床症状角度考虑，结缔组织痣主要以皮肤表面出现丘疹、结节为主，可能会在躯干、背部等地方出现一些表面光滑的一些丘疹，这些丘疹可以融合，也可以密集分布。而结节性硬化病则主要会以皮肤表面出现一些增厚性质的、光滑性的类似于痤疮一样的改变为主，还会伴随着癫痫、认知障碍、行为障碍等诸多表现。