结缔组织痣和疣状痣是不一样，主要在于发病原因和临床症状上。
结缔组织痣本身是由于遗传因素而引发，这种疾病属于一种常染色体显性遗传，也有可能是由于局部皮肤的结缔组织发育缺陷而引起；而疣状痣除了会由于自身的遗传因素导致，还可能与染色体突变有一定的关系。这种情况其实是胚胎表皮基底细胞的多功能干细胞基因突变而导致的异常现象。
而从临床症状角度考虑，结缔组织痣可能会在身体皮肤表面出现一些黄色或者灰色的丘疹样改变。这种丘疹表面光滑，中间可能会见到明显的毛囊口，还可能会形成结节样变化；而疣状痣则主要表现为黄色或者黑色的角化性丘疹，这些丘疹皮肤表面可以呈现波纹状或几何状的明显异常。