由于胰腺出现明显的纤维改变，所以孩子首先会出现大量的粪便，在粪便中也会出现黑色的粘稠性物质，更容易导致肠梗阻。
也有一些孩子在几个月之后会出现明显的腹泻，虽然还是能够摄入足够的食物，但是体重却始终不增加，生长极为缓慢，还会出现不成形的大便，味道非常隆重。
也有一些病人可能会出现继发低蛋白血症、肝硬化、又或者是维生素k缺乏症、贫血、眼干症等，也有一部分的孩子可能会出现呼吸道长时间感染，甚至最终会形成明显的慢性支气管炎，更加会造成支气管扩张症。