小腹胀气可能与功能性消化不良、肠道感染等原因有关。
多种原因造成功能性消化不良、胃动力不足、消化液分泌缺乏，影响了对食物的消化，导致胃排空延迟。大量的食物囤积在胃内经过异常发酵，产生较多的气体，引起腹部胀气。
肠道受到感染会造成肠道黏膜受损，肠道蠕动亢进，引起大便次数增多。还会造成肠道菌群紊乱，引起小腹胀气、腹部疼痛等临床表现。
除此之外，如果吃了过多产气的食物，例如豆制品、薯类、淀粉类的食物。这些食物在胃内消化分解的时候产生过多的气体，也可造成小腹胀气。