支原体感染时，通常需要选择敏感的抗生素抗炎治疗。支原体可以感染呼吸系统和泌尿系统，形成相应的支原体肺炎和尿路感染等。此时通常选择敏感的抗生素抗炎治疗，例如氟喹诺酮类的左氧氟沙星、莫西沙星，还可以选择大环内酯类的阿奇霉素、罗红霉素。
另外，还可以使用四环素类药物，例如多西环素等。通过选择此些敏感的消炎药物，予以足疗程的抗炎处理，支原体感染是可以治愈。
但要注意，此时消炎药物不能选择青霉素类和头孢菌素类，因为对支原体感染无效。当然在使用抗生素治疗同时，还需要加强支持对症处理。特别是支原体肺炎患者常干咳明显，还可口服止咳药物，例如咳必清、复方福尔可定口服液、复方甘草片等。