肛门括约肌损伤的治疗方法，可分为保守治疗以及手术治疗，治疗方法的选择主要是依据临床症状的严重程度。
肛门括约肌损伤主要会导致控便功能的下降，症状轻的仅表现为气体或者液体无法控制，就采取保守治疗方法。可以通过改善自身的饮食使粪便成形，平时避免辛辣刺激性的食物，防止出现腹泻等症状。还应该加强体育锻炼以及提肛锻炼，增强肛门部的收缩力，以缓解症状。
而对于症状严重的患者，例如对于成形粪便都无法控制的情况下，就需要考虑行手术治疗。手术方式可选择肛门括约肌缝合术，以及肛门括约肌成形术或者臀大肌移植术等。