附睾炎主要分为两种类型，不同的类型引起的原因也存在不同。
急性附睾炎通常是由于尿路感染，致使病原菌沿输精管侵入到附睾所引起。另外，由于前列腺摘除手术后，留置导尿管或经尿道器械操作等，都可引起急性附睾炎。针对急性附睾炎，如果没能积极对症治疗，或者是治疗不彻底，很容易逐渐转化为慢性附睾炎。大肠杆菌是慢性附睾炎的常见致病菌。
另外，肠球菌、葡萄球菌以及变形杆菌等，也可引起附睾炎。致病菌通常会经由输精管逆行蔓延至附睾而引起附睾炎。主要是因为输精管的开口位于前列腺窝部位，排尿时由于尿道的压力作用，便可将存在病原菌的尿液逆流进入输精管，进而诱发附睾炎。