红眼病应当根据其感染的病原体给予抗感染治疗。本病可由细菌或者病毒感染导致，因此药物治疗可以给予抗生素滴眼液或者抗病毒药物，常用的有加替沙星滴眼液、洛美沙星滴眼液、阿昔洛韦眼液或者更昔洛韦眼用凝胶。
若眼部炎症较重，可以配合使用非甾体类消炎药，比如溴芬酸钠滴眼、普拉洛芬滴眼液等。
若眼部分泌物较多，可以做结膜囊冲洗。若伴有伪膜形成，则应将伪膜去除后，再用药物治疗，否则伪膜会影响药物的吸收、影响治疗效果。