在通常情况下，新冠肛拭子和鼻咽拭子的结果应该相同，保持一致。但并不是对于所有的人群都会有保持一致的结果。
对于一些无症状的感染者或者轻症感染者来讲，感染以后病情会恢复很快，因此很有可能在第三天到第五天左右鼻拭子检测不到阳性的指标。
但是，通过研究结果发现一部分人群粪便的肛拭子核酸阳性持续的时间，会比呼吸道采集的鼻咽拭子持续的时间更加长久，因此增加了肛拭子的核酸检测，能够提高感染者的被检出率，减少漏诊。
对于一部分假阴性的患者来讲，鼻部的鼻咽拭子核酸虽然有可能呈阴性，但是肛拭子有可能呈阳性。