持久性房颤会导致脑卒中的原因是持久性房颤更容易在左心房形成附壁血栓，血栓脱落就会导致脑卒中。持久性房颤是房颤持续时间大于一年，不能恢复窦律或恢复窦律后又复发的房颤。
该房颤比其它类型的房颤，更容易在左心房内形成附壁血栓。因为持久性房颤的心房是持续、快速、不规律的收缩。心房彻底失去了有效射血，更容易造成血液淤积，形成湍流，损害心房内壁细胞，引起血小板聚集，进而形成血栓。而血栓一旦脱落，就会到达左心室，左心室收缩后，血栓就会随血流到达脑部，导致脑卒中。
故持久性房颤时，应积极应用华法林等抗凝治疗，以预防脑卒中的发生。