如果长期不吃早餐，会对消化道和消化器官造成损害，如胃炎和消化性溃疡、黏膜糜烂、胆囊炎、胆结石等。
不吃早餐，中午就会吃得多，长期下去容易导致身体肥胖，而且也可能会引发急性胰腺炎。不吃早餐会引起低血糖，一旦低血糖发生，对脑细胞的损害不可逆转。不吃早餐会出现注意力不集中、反应迟钝，特别是在精密作业中或是危险作业，容易发生事故。
如果经常不吃早餐，很容易导致脱发。因为人体缺乏蛋白质，体内的角蛋白水平会造成不同程度的影响，吃早餐可以促进毛囊生长。