小儿消化不良是否可以打预防针，要根据具体病情决定。如果宝宝仅表现为消化道症状，体温正常并且精神状态良好的情况下，是可以打预防针。如果宝宝除了消化系统不适症状外，还伴有体温升高、精神状态差等症状是不可以打预防针。
因为宝宝在接种疫苗后，由于疫苗的吸收过程中会出现轻微的发热症状，容易加重宝宝高热，甚至会影响疫苗的吸收，同时对宝宝正常的生长发育不利。
因此，建议家长要视情况而定，不要盲目的给宝宝接种疫苗，必要的时候可以延迟接种。